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財政部中區國稅局民權稽徵所表示，獨資、合夥組織營利事業出售房地，因該房地登記所有權人為個人，與具獨立法人格的營利事業主體有所不同，因此房地合一2.0上路後，獨資、合夥組織應依個人課稅規定申報房地合一稅。
不過獨資、合夥組織營利事業如果在2021年6月30日前出售房地，依舊適用房地合一稅1.0，出售房地交易所得由應計入營利事業所得額申報。
中區國稅局表示，為防杜短期炒作不動產，維護租稅公平及落實居住正義，房地合一稅2.0從2021年7月1日起施行，營利事業交易符合《所得稅法》第4條之4規定之房屋、土地、房屋使用權、預售屋及其坐落基地、符合一定條件的股份或出資額（以下合稱房地），應依房地合一稅2.0規定，就交易所得按持有期間，兩年以內課徵45%、超過兩年未逾五年35%、超過五年課徵20%稅率、超過十年課徵15%稅率。
屬於獨資或合夥組織的營利事業在不動產交易時，應按個人規定辦理，在出售房地完成所有權移轉登記日之次日起算30日內，向戶籍地稽徵機關申報該房屋、土地交易所得額，獨資或合夥事業出售房地的交易所得，仍應在出售房地的次年5月辦理營所稅申報，不過免計入營利事業所得額課稅。
國稅局表示，在房地合一1.0期間（2016年至2021年6月底），出售不動產所得須先行列入營利所得範圍，再歸課到個人綜合所得稅，再依個人適用綜所稅率5％至45％課稅。
不過，我國自2018年實施所得稅改方案，對獨資合夥的資本主或合夥人經營事業所得採穿透課稅，免再課營所稅，但所得必須列為個人綜合所得稅的營利所得項目，和過去要申報營所稅，之後再從申報綜所稅以憑證扣抵有所不同。
因此，2021年7月後房地合一2.0上路後，我國將獨資合夥組織交易不動產全面改為比照個人，若獨資合夥組織有出售不動產行為，必須在移轉登記日後30天內申報，且適用15％至45％房地合一稅率。
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