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南區國稅局表示，營利事業總機構在我國境內，應就境內、境外全部營利事業所得，合併課徵營所稅；但為避免發生重複課稅，境外所得已依所得來源國稅法規定繳納的所得稅，可扣抵營所稅應納稅額，但要留意三事項。
官員表示，營利事業申報境外所得額在計算可扣抵稅額時，要注意一、境外所得額是指，國外收入減除所提供相關成本費用後的所得額，而不是將國外收入全數列為所得。
其次，可扣抵境外稅額，是依所得來源國稅法規定繳納的所得稅，按實際繳納稅款日的匯率換算成新台幣金額，營利事業應提出在該國稅務機關同一年度納稅憑證，扣抵的數額不能超過因加計國外所得，依國內適用稅率計算增加的結算應納稅額。
第三，境外所得如果是依租稅協定，屬於他方締約國免課稅的所得，或訂有上限稅率的所得，因此溢繳的國外稅額，不能在我國申報扣抵。但可以和締約國申請退稅。
國稅局舉例，甲公司2022年度取得泰國公司給付的權利金收入1,000萬元，境外扣繳稅額150萬元，而這筆收入的相關成本費用是200萬元，甲公司列報2022年度營利事業所得稅時，因加計國外所得而增加的結算應納稅額為160萬元［(1,000萬元-200萬元)×20%］；雖然甲公司在泰國實際繳納的所得稅為150萬元，未超過可扣抵稅額上限160萬元。
不過依我國與泰國簽署的租稅協定規定，權利金的上限稅率為10%，因此，甲公司境外所得可扣抵稅額僅能列報100萬元（1,000萬元×10%），溢繳的境外稅額50萬元（150萬元－100萬元）不能在台申報扣抵。
但因為我國和泰國簽有租稅協定，因此營利事業可向所轄國稅局申請居住者證明，並檢具泰國稅務機關規定的申請文件，依租稅協定向泰國稅務機關申請退還稅額。
南區國稅局提醒，營利事業申報境外所得可扣抵稅額時，應將取得的收入減除相關成本及費用計算出境外所得，再依國內適用的稅率計算可扣抵稅額的限額，並要注意是否有租稅協定的適用。
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