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行政院推動「自然碳匯」關鍵戰略，積極開發森林、土壤、海洋等三大類自然碳匯，但在紅樹林植林、海草復育目前仍在建構，「藍碳」還卡關在向環境部提出方法學的審查階段。專家透露，由於國內在海洋藍碳的方法學建立上仍在初期，因此包括邊界界定、計算方式、物種影響等，都還需要更科學的方法佐證。
藍碳碳匯有潛力 但可能造成之影響仍不確定
海洋是世界上最大的碳匯，海保署統計2019年起陸續盤點我國藍碳生態系分布及面積，並於2024年更新調查結果，全台沿海藍碳生態系面積約8,945公頃，其中海草床所占面積最大7,818公頃，其次為紅樹林938.8公頃，鹽沼188.33公頃，綜合全台三種沿海藍碳碳儲存量約為47萬公噸。
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