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非居住者申報房地合一稅時，要留意適用稅率與我國居住者不同，持有房地在兩年內，稅率為45%，持有超過兩年，稅率則為35%，納稅人應留意稅務身分，以免申報錯誤遭到補稅。
「非居住者」可能是外僑、外籍人士等。在稅法上，若在中華民國有住所、經常居住境內者，或是雖無住所、但同一年度於境內居留滿183天者，都屬於居住者；如不符合前述規定，即為非居住者。
國內許多稅制針對居住者、非居住者規定多會有所差異，房地合一稅也不例外。
財政部台北國稅局表示，2021年7月1日起，房地合一2.0上路，針對非居住者交易房地合一稅制適用範圍的房屋、土地，課稅所得適用的稅率有兩種，是以持有期間兩年為分界點。
若持有房地在兩年以內，則要以45%稅率課稅；持有超過兩年，則適用稅率為35%。
國稅局官員表示，倘若稅務身分為居住者，交易持有兩年內房地，稅率45%，逾兩年未超過五年，稅率則為35%，超過五年、未逾十年稅率20%，持有超過十年稅率降到15%。
國稅局舉例，納稅人甲君在2016年間買賣取得某房地，在2022年間出售，甲君自行申報課稅所得1,500萬元，他認為持有時間超過五年、未滿十年，依居住者稅率20%計算稅額為300萬元。
然而國稅局查到，甲君為外僑，交易年度在台灣並無戶籍，也未在台灣境內居留滿183天，因此稅務身分應為非居住者，持有超過兩年以上，稅率應依35%計算，國稅局重新核定稅額為525萬元，補稅225萬元。
國稅局官員表示，居留天數滿183天即為我國稅務居住者，是以全年度來認定，若交易當時尚未滿183天，適用非居住者稅率，但後來在年底前居留滿183天，成為居住者，則可回頭向國稅局申請更正，改按居住者稅率來課徵房地合一稅。
國稅局提醒，個人出售房地合一稅制課稅範圍的房屋、土地，應在完成所有權移轉登記日次日起算30日內，依其為居住者或非居住者身分，按適用稅率報繳房地合一稅，以免遭補稅。
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